东芬兰大学的院系设置

约恩苏校区下设六个系：教育系，林业系，人文系，自然科学系，社会科学系和神学系。

库奥皮奥大学下设5个系：商务和信息技术系，医学系，自然与环境科学系，医药学系及社会科学系。